Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
R3HDM1Q15032 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms