Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
AP3B2Q13367 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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