Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
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