Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPS29P62273 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RPS29P62273 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPS29P62273 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RPS29P62273 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms