Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
EPHB4P54760 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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