Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CNTN3Q9P232 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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