Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms