Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SGCZQ96LD1 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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