Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CSPP1Q1MSJ5 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms