Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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