Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
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