Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SKIV2LQ15477 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms