Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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CUL3Q13618 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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