Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SLFN5-203ENST00000592325 1225 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 NEK10-201ENST00000295720 2871 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms