Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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SGCGQ13326 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SGCGQ13326 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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