Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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