Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms