Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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