Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SREBF2Q12772 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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