Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms