Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRBP23467 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms