Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 NLRP4-201ENST00000301295 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TRHP20396 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL929601.3-201ENST00000613990 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TRHP20396 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TRHP20396 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TRHP20396 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TRHP20396 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TRHP20396 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TRHP20396 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TRHP20396 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms