Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ERVV-2B6SEH9 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms