Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
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