Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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