Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTF1AQ7RTS3 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTF1AQ7RTS3 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms