Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL24A1Q17RW2 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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