Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms