Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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COL19A1Q14993 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL19A1Q14993 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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COL19A1Q14993 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
COL19A1Q14993 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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