Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms