Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms