Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NEUROD1Q13562 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms