Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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