Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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