Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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BPTFQ12830 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BPTFQ12830 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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