Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHRNEQ04844 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms