Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DSG1Q02413 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms