Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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