Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms