Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 MIR7150-201ENST00000614393 94 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 SYNPO2-204ENST00000448416 4298 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TRHP20396 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 HCG18-242ENST00000602319 3342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 GSTCD-211ENST00000515279 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TRHP20396 LDB2-201ENST00000304523 2548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TRHP20396 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms