Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms