Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM47Q96LD4 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM47Q96LD4 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TRIM47Q96LD4 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM47Q96LD4 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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