Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ASS1P4-201ENST00000439462 1234 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL158819.1-202ENST00000440645 447 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF341-AS1-203ENST00000443171 642 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PMS2P10-201ENST00000447708 612 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LDHAP3-201ENST00000448312 1008 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS29P16-201ENST00000452798 171 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC00894-207ENST00000452864 750 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SL586P-201ENST00000479137 296 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL121612.1-201ENST00000490252 615 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNORA33.3-201ENST00000516236 136 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP001767.2-201ENST00000527291 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 IGHV1OR15-4-201ENST00000560037 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC013565.2-201ENST00000564874 310 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC006130.1-201ENST00000589365 555 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P46-208ENST00000598619 490 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL158835.1-202ENST00000607914 365 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GPX2-205ENST00000612794 1084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SNX18P5-201ENST00000619873 868 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.160-201ENST00000622203 277 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC134981.1-201ENST00000628076 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PKP4-218ENST00000629219 162 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms