Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms