Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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