Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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BRD3Q15059 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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BRD3Q15059 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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BRD3Q15059 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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BRD3Q15059 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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