Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms