Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL3Q13618 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms