Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PICALMQ13492 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms