Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NME3Q13232 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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